Основная масса органического материала в Черном море образуется в процессе фотосинтеза. Главную роль при этом играют мельчайшие одноклеточные водоросли. От скорости продуцирования ими органического вещества прямо или косвенно зависит существование основных групп морских организмов. В расчете на всю акваторию фотосинтезирующие водоросли за последние 2000 лет производили около 100 г органического углерода на кубический метр в год. К тому же некоторое количество органического углерода поступало в виде детрнтного материала вместе с речной взвесью из Азовского и Мраморного морей (менее 10%). По оценке Шимкуса и Тримониса, на долю органического вещества, поставляемого реками, приходится около одной трети всего его количества. Помимо этого, органический углерод образуется в процессах хемосинтеза. Это — органический углерод, заново синтезируемый аутотрофными бактериями, количество которого точно не известно.