Методы микроскопического исследования (в обычном, отраженном и проходящем свете или в ультрафиолете) применяются как для изучения пород, содержащих кероген, так и для анализа предварительно выделенного керогена. Эти методы в комбинации с электронной микроскопией дают возможность обнаружить и в некоторых случаях диагностировать в породах частицы керогена. Долгое время микроскопические наблюдения применялись в угле-петрографии для идентификации мацералов угля и для оценки степени их углефикации в ряду от торфа к антрациту. Относительно недавно эти микроскопические методы стали употребляться также при изучении тонкорассеянных форм керогена в других осадочных породах с целью оценки степени их катагенетической преобразованное (замеры отражательной способности). Этому вопросу были посвящены многие работы, о которых будет сказано-позднее. Однако до недавнего времени мало внимания уделялось идентификации и диагностике частиц керогена. Б этом направлении были выполнены лишь немногочисленные работы, главным образом при палинологических и углепетрографических исследованиях].